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01月
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- 教育部與行政院原住民委員會會銜發布〈原住民學生升學優待及原住民公費留學辦法〉。
- 總統令公布〈圖書館法〉。
- 教育部修正發布〈中學校長遴選聘任級任期考選辦法〉。
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02月
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- 「財團法人技專校院入學測驗中心」二月十六日在雲林科技大學成立。
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03月
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- 教育部宣布八十九學年度第二學期起實施「學生體適能護照」，包括國小四年級至高中（職）三年級。
- 教育部會銜大陸委員會，函請行政院同意華東臺商子女學校籌設案。
- 教育部發布〈大學增設、調整系所班組及招生名額採總量發展方式審查作業要點〉。
- 九十年度全面實施多元入學方案，國中基本學力測驗第一次測驗於三月三十一日、四月一日在全臺各地十八個試務區舉行。
- 教育部發布〈國民中小學學生成績評量準則〉。
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04月
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- 總統府指示規劃辦理「中華民國九十年度第一屆總統教育獎」。
- 教育部成立〈教育部人權教育委員會〉。
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05月
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- 教育部發布〈高級中學教科用書審定辦法〉。
- 華東臺商子女學校獲准籌設，九十學年度正式招收幼稚園到國中學生，同步實施國民中小學九年一貫新課程。
- 教育部修正發布〈高級中學校長遴選聘任及任期考評辦法〉。
- 教育部發布「高中職社區化推動方案」。
- 教育部與財政部會銜發布〈財團法人私立學校私人興學基金會組織及運作辦法〉。
- 教育部發布〈教育部補助社區大學及相關團體要點〉。
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06月
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- 教育部發布〈專科以上學校遠距教學作業規範〉。
- 教育部發布〈人權教育實施方案〉及相關辦法。
- 教育部發布〈中小學資訊教育總藍圖〉。
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07月
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- 教育部發布〈教育部教育經費分配審議委員會設置及審議辦法〉。
- 教育部發布《大學教育政策白皮書》。
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08月
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- 九十一學年度起公立國中小學全面實施總量管制，各校可開放十分之一的員額自行聘任所需教師，並自行裁併、新增、調整學校組織。
- 東華大學成立「原住民民族學院」。
- 教育部發布臺大等九所國立大學列為重點研究型大學。
- 第一屆總統教育獎在總統府舉行頒獎儀式，由總統親自頒發，共四十二名學生獲獎。
- 教育部修正發布〈高中及高職多元入學方案〉。
- 教育部發布「國立大學校院區域資源整合發展計畫」。
- 九十學年度起實施中小學師資合流培育，開放師範學院同時培育中學、小學與幼稚園師資，充實師院師資培育課程。
- 教育部委託國立臺灣師範大學國語教學中心、華語文教學研究所與心 理教育測驗中心三個研究團隊共同研發「華語文能力測驗」。
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09月
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- 自九十年度起於〈大學學術追求卓越發展計畫〉項下推動〈提升大學基礎教育計畫〉。
- 教育部發布〈教育部辦理大學學門評鑑作業要點〉。
- 教育部推動〈身心障礙學生十二年就學安置計畫〉。
- 教育部發布〈國立高級中學多元入學招生辦法〉。
- 行政院核定〈學校健康促進計畫〉。
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10月
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- 中央研究院發布〈中央研究院與國內各大學合作辦理國際研究生學程要點〉。
- 教育部發布〈學校健康促進計畫〉。
- 教育部發布〈高級中等以上學校護理教師資格遴選派任遷調辦法〉。
- 教育部發布〈大學辦理進修學士班審核作業要點〉。
- 教育部發布〈綜合高級中學實施要點〉。
- 教育部發布〈留、遊學服務業分工管理機制處理原則〉。
- 教育部發布〈大學辦理申請入學審核作業要點〉。
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11月
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- 教育部發布〈大學辦理研究所（系）碩士及大學部二年制在職專班審核作業要點〉。
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12月
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- 總統令修正公布〈國立大學校院校務基金設置條例〉。
- 總統令公布修正〈國民教育法〉。
- 配合行政院計畫，完成推動部屬機關、公私立大專校院、高中職等實施公文電子交換作業。
- 總統令公布修正〈特殊教育法〉。
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